为了有效地管理国家也为了替子孙万代奠定基业秦始皇吸取了战国时期设置官职的具体经验建立了一套相当完整的中央集权制度和政权机构。
中央机构
中央设丞相、太尉、御史大夫。丞相有左右二员掌政事。太尉掌军事不常置。御史大夫是丞相的副2掌图籍秘书监察百官。
丞相、太尉、御史大夫以下是分掌具体政务的诸卿其中有掌宫殿掖门户的郎中令掌宫门卫屯兵的卫尉掌京畿警卫的中尉掌刑辟的廷尉掌谷货的治粟内史掌山海池泽之税和官府手工业制造以供应皇室的少府掌治宫室的将作少府掌国内民族事务和外事的典客掌宗庙礼仪的奉常掌皇室属籍的宗正掌舆马的太仆等。丞相、太尉、御史大夫与诸卿议论政务皇帝作裁决。
在此之外秦代还有一些比较重要的官职比如博士—“掌通古今”即通晓古今史以备皇帝咨询同时负责图书收藏；典属国—与典客一样主管少数民族事务不同的是典客掌管与秦友好的少数民族的交往而典属国则负责已投降秦朝的少数民族；詹事—管理皇后和太子的事务；将作少府—负责宫殿建造。
秦王朝建立的这套中央集权机构的政权机构以后一直被历代王朝所仿效。其中汉代的“三公九卿”基本上是照搬秦制。
地方机构
秦始皇统一六国后采纳李斯的建议废除分封制改行郡县制。地方行政机构分郡、县两级。郡县主要官吏由中央任免。
郡设守、尉、监（监御史）。郡守掌治其郡。郡尉辅佐郡守并典兵事。郡监司监察。秦始皇把全国分成三十六郡以后又6续增设至四十一郡。
他们是：
秦地：巴郡蜀郡陇西郡北地郡；
赵地：太原郡云中郡邯郸郡巨鹿郡雁门郡代郡常山郡；
魏地：上郡河东郡东郡砀郡河内郡；
韩地：三川郡上党郡颍川郡；
楚地：汉中郡南郡黔中郡南阳郡陈郡薛郡泗水郡九江郡会稽郡长沙郡衡山郡；
齐地：东海郡齐郡琅琊郡胶东郡济北郡；
燕地：广阳郡上谷郡渔县郡右北平郡辽西郡辽东郡；
南越故地：闽中郡南海郡桂林郡象郡；
匈奴故地：九原郡。
县万户以上者设令万户以下者设长。县令、长领有丞、尉及其他属员。县令、长主要管政务县尉掌握军事县丞掌管司法。
县以下有乡其主要职能有四：1.摊派徭役；2.征收田赋；3.查证本乡被告案情；4.参与对国家仓库粮食的保管工作。乡设三老掌教化啬夫掌诉讼和赋税游徼掌治安。
乡下有里是最基层的行政单位。里有里典后代称里正、里魁以"豪帅"即强有力者为之。里中设置严密的什伍户籍组织以便支派差役收纳赋税。并规定互相监督告奸一人犯罪邻里连坐。此外还有司治安、禁盗贼的专门机构叫做亭亭有长。亭除了主要管理治安还负责接待往来的官吏掌管为政府输送、采购、传递（文书）等事。两亭之间相距大约十里。
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