1560年5月5日出生，是日本安土桃山时代的武士，父亲为后藤基国，黑田家家臣，一般惯称为后藤又兵卫，是黑田二十四骑、黑田八虎、日本七柱枪之一。
原来播磨国大名别所长治的家臣三木城主后藤基国之子，他的出生年月有很多不同说话，一般认为是生于永禄三年（1560年），又兵卫幼年丧父，少年时还idaizai流离失所中渡过，后来辗转投靠了丰臣家著名的军师、智将黑田官兵卫孝高。
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永禄年间，黑田孝高曾经作为播磨大名小寺政职家的家臣而被称作小寺官兵卫，而小寺、别所两家同为播磨名门赤松氏的支系，所以孝高与又兵卫之父基国也算是有所关联。于是又兵卫在黑田家得到了孝高的重视和培养。再加上又兵卫本身在兵法和枪术上都资质过人，履历战功，很快就在乱世扬名，成为有名的“黑田八虎”之一，与家中的母里太兵卫、黑田长政等猛将齐名。
后来，到了黑田官兵卫将家督之位让与长子长政之后，后藤又兵卫已经是黑田家的家老重臣。他在随长政出兵朝鲜的战斗中表现活跃，曾经在晋州的围城战中立下先登之功，并流传下了以三千人对抗明军三万人而不败的战绩，因而与另一名家老母里太兵卫一同被称作黑田家的“双璧”。
在黑田长政由于在袭击石田三成前，后藤基次看到了秀秋的用所作为，提出了不同的意见，让黑田长政心中怀恨，后移封黑田家，黑田长政更加忌闲妒能，处处排挤又兵卫。
其实这里还流传着这样的说法：据说黑田军在一次渡河战役中与朝军激烈交战，黑田长政本阵也卷入了战斗，与敌人犬牙交错的激烈厮杀，长政本人也不得不亲自与敌人交锋，形势十分危急。而随后赶到的的后藤又兵卫，并没有急于加入战阵救援，而是在审视局势后，认为长政的本阵并非十分危险，自己与其盲目参战抢了主君的功劳，还不如坐镇指挥全局以取得更稳妥的胜利。于是又兵卫命令本部人马押住阵脚，他本人则坐在高处指挥全局，显示了“不动如山”的大将风范。当长政奋力杀退敌军之后，已经是身负多处轻伤，丢盔卸甲狼狈不堪，回到阵地时却发现又兵卫正“悠闲的”坐在总大将的位子上指挥，不由得心生怨恨，认为又兵卫作为家臣，不但见死不救，反而有心看主君出丑，从此一心想要报复。
不管何种传说，黑田长政与后藤基次两人的矛盾重重，最重在移封后瞬间爆发，又兵卫的长子后藤基则当时是长政的小姓，同时也以善于击鼓而在黑田家闻名。有一次，长政故意在酒宴时命基则下场为能乐师击鼓助兴，这一无礼的要求使得身为武士的基则深感耻辱，当时便愤然离席。
当时的又兵卫早已经对黑田长政的种种无礼刁难感到十分气愤，但生性刚毅的他却从来不愿向长政示弱。闻得此事后，又兵卫感觉再也无法继续在黑田家任职了，当晚便带领全族人出奔，从此离开了筑前黑田家，成为了浪人。
从黑田家出奔后，在秀秋率兵返回九州筑前国抵抗朝鲜李珲入侵的时候，投靠到了秀秋的麾下，得到了秀秋的器重。在赤间关抗拒战中抵挡朝鲜军进攻长达半年之久，得到了秀秋的重用，成为八名老中的一员。
后又在讨伐朝敌大友义统和岛津义弘战中得到了大功，成为了秀秋谋得天下的臂力。
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